ソースコードからClustal Omegaをインストールする

この手順は M1 Mac を前提としています。

1. ソースコードをダウンロードして展開します。

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   wget http://www.clustal.org/omega/clustal-omega-1.2.4.tar.gz && tar -xzvf clustal-omega-1.2.4.tar.gz && cd clustal-omega-1.2.4
   

2. Homebrew で argtable をインストールします。

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   # You need install the Homebrew first if you haven't installed it.
   /bin/bash -c "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/HEAD/install.sh)"
   
   brew install argtable
   

3. コンパイルしてインストールします。

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   ./configure CFLAGS='-I/opt/homebrew/Cellar/argtable/2.13/include' LDFLAGS='-L/opt/homebrew/Cellar/argtable/2.13/lib'
   make
   make install 
   

4. インストールを確認します。

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   which clustalo
   

5. あとは次のように使えます。

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   cd /path/to/your/sequence
   clustalo -i sequence.fasta -o output.fasta --seqtype=protein