극성 상호작용 표시
- 모델에서 리간드를 선택하고 객체 이름을 'ligand'로 바꿉니다.
- 리간드를 선택한 다음
actions->around->residues within 5 angstrom을 실행하고, 선택된 객체의 이름을 'active'로 바꾼 다음 잔기를 스틱(sticks)으로 표시합니다. - 극성 상호작용을 확인합니다:
action->find->polar contacts->to other atoms in object. - 일부 점선이 빈 공간으로 이어질 수 있는데, 이는 숨겨진 물 분자 때문일 수 있습니다.
select $LigandWater, (($ligand)around 3.2) and(resn HOH)로 3.2 Å 이내의 물 분자를 표시하세요(수소 결합 거리는 3.2 Å 이내입니다). 그러면 '$LigandWater'라는 객체가 생성됩니다.
내보내기
- 원자 위에서 마우스 가운데 버튼을 클릭하면 그 원자가 중심으로 설정됩니다. 상호작용이 잘 보이도록 적절한 각도로 회전하세요.
- 배경을 흰색으로 표시합니다:
Display->background->white. - Draw/Ray를 클릭하고 DPI를 300으로 설정한 다음 ray를 클릭합니다.
- 원한다면 그림자를 제거할 수 있습니다:
setting->Rendering->shadows->None.