Clustal Omega를 소스 코드로 설치하기

이 절차는 M1 Mac을 기준으로 합니다.

1. 소스 코드를 다운로드하고 압축을 풉니다.

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   wget http://www.clustal.org/omega/clustal-omega-1.2.4.tar.gz && tar -xzvf clustal-omega-1.2.4.tar.gz && cd clustal-omega-1.2.4
   

2. Homebrew로 argtable을 설치합니다.

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   # You need install the Homebrew first if you haven't installed it.
   /bin/bash -c "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/HEAD/install.sh)"
   
   brew install argtable
   

3. 컴파일하고 설치합니다.

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   ./configure CFLAGS='-I/opt/homebrew/Cellar/argtable/2.13/include' LDFLAGS='-L/opt/homebrew/Cellar/argtable/2.13/lib'
   make
   make install 
   

4. 설치가 제대로 되었는지 확인합니다.

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   which clustalo
   

5. 그러면 다음과 같이 사용할 수 있습니다.

   BASH복사

   cd /path/to/your/sequence
   clustalo -i sequence.fasta -o output.fasta --seqtype=protein