Note
이 방법은 아마 1년 전쯤 작성된 것으로, 단지 메모 목적으로만 공개합니다.
소개
Xia2는 거대분자 결정의 X선 회절 데이터를 자동으로 리덕션하는 전문가 시스템입니다. 오픈소스이며 소스 코드는 여기에서 받을 수 있습니다.
제 작업 흐름에서는 Xia2가 XDS보다 훨씬 사용하기 쉽습니다. 다만 Xia2는 CLI에서만 실행할 수 있고, XDS에는 GUI인 XDSGUI가 있습니다.
사용법
이미지가 들어 있는 폴더로 디렉터리를 변경한 뒤 다음을 실행하면 됩니다.
BASH
xia2 pipeline=dials .
Xia2는 데이터를 처리할 때 dials, dials-aimless, XDS, XSCALE 등 여러 종류의 파이프라인을 활용할 수 있습니다. 많은 매개변수는 여기에서 찾을 수 있습니다. SSRF 10U2에서 데이터를 수집하는 경우에는 goniometer.axes=0,1,0을 추가해 고니오미터 축을 변경해야 할 수도 있습니다.
BASH
xia2 pipeline=dials-aimless ./ goniometer.axes=0.000000,1.000000,0.000000 xia2.settings.resolution.d_min=1.89
[!NOTE]
위 링크에 있는 매개변수 목록은 완전해 보이지 않고, 저도 완전한 목록을 찾지 못했습니다. 다만 Xia2를 실행한 디렉터리에 있는 Phil 형식 파일을 참고하면 됩니다.
결과 확인
실행 디렉터리에 요약이 담긴 xia2.html 파일이 생성됩니다.